Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms