Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tns3Q5SSZ5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tns3Q5SSZ5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tns3Q5SSZ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tns3Q5SSZ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tns3Q5SSZ5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms