Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms