Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rbm27Q5SFM8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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