Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms