Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms