Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms