Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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