Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms