Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Shisa3Q3UPR0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Shisa3Q3UPR0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Shisa3Q3UPR0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Shisa3Q3UPR0 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Shisa3Q3UPR0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shisa3Q3UPR0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms