Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UPC7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms