Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tmem253Q3UNB8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms