Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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