Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam35aQ3UEN2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms