Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtulinQ3UCV8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms