Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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