Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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