Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms