Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Map9Q3TRR0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map9Q3TRR0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map9Q3TRR0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map9Q3TRR0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map9Q3TRR0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms