Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms