Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cers3Q1A3B0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cers3Q1A3B0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cers3Q1A3B0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cers3Q1A3B0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cers3Q1A3B0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms