Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms