Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms