Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms