Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms