Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms