Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms