Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms