Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms