Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms