Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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