Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms