Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms