Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms