Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja5Q01231 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms