Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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