Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms