Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms