Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbp1Q00915 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms