Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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