Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pou1f1Q00286 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pou1f1Q00286 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pou1f1Q00286 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pou1f1Q00286 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pou1f1Q00286 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou1f1Q00286 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms