Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stx2Q00262 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms