Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms