Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl39P62892 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms