Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms