Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp20P57748 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms