Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms