Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GferP56213 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GferP56213 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms