Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgd1P52734 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgd1P52734 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms