Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RorcP51450 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms